<link rel="shortcut icon" id="favicon_id" href="http://вашсайт/favicon.ico">
<script>
setTimeout(function() {document.getElementById('favicon_id').href='Второе изображение.gif'}, 1000)
setTimeout(function() {document.getElementById('favicon_id').href='Третее изображение.gif'}, 2000)
setTimeout(function() {document.getElementById('favicon_id').href="Четвертое изображение.gif'}, 3000)
setTimeout(function() {document.getElementById('favicon_id').href='Последнее изображение.gif'}, 4000) }
</script>
Ставим после <head>
